Fornixin runko liittyy hippokampukseen ja rintakehoon, aivojen pohjassa oleviin rakenteisiin, jotka ovat mukana muistinmuodostuksessa ja muistissa. Se on osa limbistä järjestelmää.
Fornixin runko on vain yksi segmentti neljästä komponentista, jotka muodostavat aivojen fornixin. Muut elementit ovat fimbria, crus ja pylväs.
Fornix on C-muotoinen ja on hippokampuksen muodostumisen päärakenne. Se on joukko hermosolukuituja, jotka ulkonevat corpus callosumin alapinnasta, hermokuituja, jotka yhdistävät aivojen kaksi puoliskoa. Sieltä fornixin runko ulottuu kammioiden väliseen forameniin, joka on aukko aivojen keskellä. Foramenin vieressä fornixin runko muodostaa fornixin etuosan (etu) sarakkeet septum pellucidumin, joka on aivojen keskiviivalla, kalvo.
TT-kuvantamistutkimuksissa fornixin rungon nähdään roikkuvan septum pellucidumin ohuesta, ylemmästä (ylemmästä) osasta. Se sijaitsee kolmannen kammion tela choroidea (sidekudos) ja ependymal-katon (kalvopäällyste) yläpuolella, nesteen täyttämä ontelo aivoissa.